按照修旧如旧的原则保持了原体育馆的外观和框架，内部中段空间添加夹层，形成二层展区；后部保留原司马德游泳池并加以扩建，分为地下与地上三层，整个建筑风格与司马德体育馆和谐统一。博物馆以《跨越百年的流芳》主题展览为主线，展现苏州大学百十年发展历程的实物展品，同时分为《艺苑菁华》、《文物荟萃》、《蓝白世界》、《东吴碑廊》等部分陈列具有吴文化地域特点的展品，涉及陶瓷器、青铜器、玉器、字画、碑刻、蓝印花布等各类文物。另外，博物馆还设有临时展厅，举办有特色的、专门性的临时展览。全馆收藏有各类藏品千余件，其中中国创刊最早的大学学报《学桴》杂志、保存完整的越国原始瓷甬钟、明代吴门书派碑刻等等都是非常珍贵的藏品，博物馆开馆后将面向全校师生开放。